Utvärdering av Biosynex AMPLIQUICK® Fecal Parasitology multiplexpaneler för intestinal parasitdiagnostik med realtids-PCR : Jämförelse av förbehandlings- och extraktionsprotokoll samt metodologisk resultatjämförelse mot mikroskopi

Sammanfattning

Studien utvärderade Biosynex AMPLIQUICK® Fecal Parasitology multiplexpaneler för detektion av protozo- och helmintinfektioner med realtids-PCR. Utvärderingen utfördes genom en jämförelse av tre olika förbehandlingar samt två olika extraktioner på sparade frysta fecesprover, positivt påvisade för protozoer respektive helminter. Prospektiva patientprover användes till en metodologisk resultatjämförelse mellan realtids-PCR och mikroskopi. DNA extraherades automatiserat och analyserades med Biosynex AMPLIQUICK® PCR-strip. Databearbetning genomfördes i Excel. Resultaten visade att Mikrobiologiska laboratoriets, Länssjukhuset Ryhov, enzymatiska samt fysikaliska rutinförbehandling i kombination med EZ1 DNA Bacteria Card v1.0 genererade lägst Cycle threshold-värden och högst detektionsfrekvens. Biosynex AMPLIQUICK® Fecal Pretreatment med mekanisk förbehandling uppvisade lägre prestanda. Mikroskopi och realtids-PCR visade god överensstämmelse. En högre andel positiva prover observerades för realtids-PCR, vilket antyder en högre känslighet för metoden.